Protein–RNA interactions for Protein: P49748

ACADVL, Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADVLP49748 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms