Protein–RNA interactions for Protein: P49748

ACADVL, Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADVLP49748 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACADVLP49748 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACADVLP49748 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACADVLP49748 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADVLP49748 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADVLP49748 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms