Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRPC1P48995 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC1P48995 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC1P48995 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC1P48995 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms