Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSMC4P43686 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSMC4P43686 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PSMC4P43686 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSMC4P43686 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms