Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC1A3P43003 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A3P43003 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A3P43003 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms