Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASRP41180 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASRP41180 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASRP41180 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASRP41180 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASRP41180 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASRP41180 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASRP41180 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASRP41180 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASRP41180 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASRP41180 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASRP41180 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASRP41180 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASRP41180 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASRP41180 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASRP41180 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASRP41180 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASRP41180 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASRP41180 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASRP41180 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASRP41180 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASRP41180 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASRP41180 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASRP41180 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASRP41180 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASRP41180 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASRP41180 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASRP41180 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASRP41180 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASRP41180 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASRP41180 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASRP41180 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASRP41180 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASRP41180 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASRP41180 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASRP41180 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASRP41180 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASRP41180 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASRP41180 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASRP41180 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASRP41180 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms