Protein–RNA interactions for Protein: P37173

TGFBR2, TGF-beta receptor type-2, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR2P37173 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TGFBR2P37173 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFBR2P37173 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFBR2P37173 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFBR2P37173 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms