Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CNGA1P29973 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGA1P29973 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGA1P29973 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGA1P29973 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGA1P29973 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms