Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HLA-DMAP28067 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-DMAP28067 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DMAP28067 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms