Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLDCP23378 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLDCP23378 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GLDCP23378 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLDCP23378 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLDCP23378 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLDCP23378 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GLDCP23378 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLDCP23378 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLDCP23378 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GLDCP23378 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLDCP23378 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLDCP23378 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLDCP23378 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLDCP23378 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GLDCP23378 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLDCP23378 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GLDCP23378 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLDCP23378 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLDCP23378 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLDCP23378 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLDCP23378 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLDCP23378 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLDCP23378 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLDCP23378 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLDCP23378 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLDCP23378 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLDCP23378 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GLDCP23378 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLDCP23378 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLDCP23378 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLDCP23378 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GLDCP23378 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLDCP23378 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLDCP23378 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLDCP23378 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLDCP23378 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLDCP23378 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLDCP23378 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLDCP23378 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLDCP23378 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLDCP23378 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLDCP23378 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLDCP23378 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLDCP23378 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLDCP23378 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLDCP23378 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GLDCP23378 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLDCP23378 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLDCP23378 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLDCP23378 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLDCP23378 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLDCP23378 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLDCP23378 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLDCP23378 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GLDCP23378 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLDCP23378 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLDCP23378 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLDCP23378 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLDCP23378 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLDCP23378 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLDCP23378 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLDCP23378 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLDCP23378 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLDCP23378 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GLDCP23378 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GLDCP23378 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GLDCP23378 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLDCP23378 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLDCP23378 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLDCP23378 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLDCP23378 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLDCP23378 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GLDCP23378 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLDCP23378 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLDCP23378 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLDCP23378 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLDCP23378 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLDCP23378 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLDCP23378 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLDCP23378 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLDCP23378 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLDCP23378 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms