Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NR1D1P20393 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1D1P20393 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1D1P20393 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1D1P20393 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms