Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAB5AP20339 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB5AP20339 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB5AP20339 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB5AP20339 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB5AP20339 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms