Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMY2BP19961 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AMY2BP19961 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AMY2BP19961 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms