Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNNI3P19429 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI3P19429 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3P19429 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms