Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYN1P17600 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYN1P17600 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYN1P17600 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYN1P17600 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYN1P17600 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYN1P17600 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYN1P17600 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYN1P17600 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYN1P17600 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYN1P17600 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYN1P17600 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYN1P17600 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYN1P17600 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYN1P17600 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYN1P17600 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYN1P17600 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYN1P17600 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SYN1P17600 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYN1P17600 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYN1P17600 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYN1P17600 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYN1P17600 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYN1P17600 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYN1P17600 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYN1P17600 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYN1P17600 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYN1P17600 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYN1P17600 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYN1P17600 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYN1P17600 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYN1P17600 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYN1P17600 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYN1P17600 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYN1P17600 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYN1P17600 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYN1P17600 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYN1P17600 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYN1P17600 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SYN1P17600 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYN1P17600 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYN1P17600 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYN1P17600 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYN1P17600 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYN1P17600 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYN1P17600 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYN1P17600 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYN1P17600 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYN1P17600 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYN1P17600 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYN1P17600 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYN1P17600 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYN1P17600 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYN1P17600 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYN1P17600 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYN1P17600 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYN1P17600 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYN1P17600 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYN1P17600 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYN1P17600 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYN1P17600 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYN1P17600 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYN1P17600 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYN1P17600 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYN1P17600 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYN1P17600 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYN1P17600 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYN1P17600 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYN1P17600 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYN1P17600 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYN1P17600 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYN1P17600 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYN1P17600 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYN1P17600 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYN1P17600 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYN1P17600 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYN1P17600 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYN1P17600 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYN1P17600 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYN1P17600 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYN1P17600 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYN1P17600 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYN1P17600 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYN1P17600 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYN1P17600 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYN1P17600 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYN1P17600 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYN1P17600 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYN1P17600 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYN1P17600 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYN1P17600 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYN1P17600 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYN1P17600 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYN1P17600 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYN1P17600 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYN1P17600 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYN1P17600 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYN1P17600 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYN1P17600 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYN1P17600 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms