Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CKMT2P17540 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKMT2P17540 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKMT2P17540 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKMT2P17540 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKMT2P17540 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms