Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOT1P17174 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOT1P17174 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOT1P17174 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOT1P17174 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOT1P17174 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOT1P17174 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOT1P17174 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOT1P17174 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOT1P17174 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOT1P17174 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOT1P17174 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOT1P17174 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOT1P17174 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GOT1P17174 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GOT1P17174 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOT1P17174 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOT1P17174 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GOT1P17174 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOT1P17174 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOT1P17174 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOT1P17174 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOT1P17174 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOT1P17174 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOT1P17174 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOT1P17174 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOT1P17174 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOT1P17174 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOT1P17174 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOT1P17174 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOT1P17174 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOT1P17174 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GOT1P17174 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOT1P17174 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOT1P17174 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOT1P17174 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOT1P17174 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOT1P17174 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOT1P17174 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOT1P17174 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOT1P17174 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOT1P17174 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOT1P17174 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOT1P17174 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOT1P17174 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GOT1P17174 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOT1P17174 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOT1P17174 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOT1P17174 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOT1P17174 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOT1P17174 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOT1P17174 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOT1P17174 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOT1P17174 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOT1P17174 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOT1P17174 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOT1P17174 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOT1P17174 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOT1P17174 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOT1P17174 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOT1P17174 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOT1P17174 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOT1P17174 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOT1P17174 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOT1P17174 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOT1P17174 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOT1P17174 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOT1P17174 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOT1P17174 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOT1P17174 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOT1P17174 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOT1P17174 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOT1P17174 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOT1P17174 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOT1P17174 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOT1P17174 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOT1P17174 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOT1P17174 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOT1P17174 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOT1P17174 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOT1P17174 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOT1P17174 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOT1P17174 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOT1P17174 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOT1P17174 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOT1P17174 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOT1P17174 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOT1P17174 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOT1P17174 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOT1P17174 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOT1P17174 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOT1P17174 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOT1P17174 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOT1P17174 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GOT1P17174 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOT1P17174 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOT1P17174 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOT1P17174 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOT1P17174 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOT1P17174 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms