Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MUC1P15941 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC1P15941 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC1P15941 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC1P15941 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC1P15941 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MUC1P15941 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC1P15941 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC1P15941 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC1P15941 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC1P15941 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC1P15941 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC1P15941 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MUC1P15941 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC1P15941 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MUC1P15941 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC1P15941 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MUC1P15941 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC1P15941 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC1P15941 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC1P15941 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC1P15941 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC1P15941 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MUC1P15941 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MUC1P15941 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MUC1P15941 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC1P15941 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC1P15941 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MUC1P15941 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MUC1P15941 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MUC1P15941 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC1P15941 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC1P15941 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC1P15941 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MUC1P15941 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC1P15941 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MUC1P15941 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MUC1P15941 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MUC1P15941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC1P15941 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC1P15941 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUC1P15941 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC1P15941 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MUC1P15941 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MUC1P15941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MUC1P15941 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MUC1P15941 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MUC1P15941 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MUC1P15941 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MUC1P15941 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUC1P15941 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUC1P15941 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MUC1P15941 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MUC1P15941 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUC1P15941 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MUC1P15941 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MUC1P15941 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MUC1P15941 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUC1P15941 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUC1P15941 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MUC1P15941 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MUC1P15941 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MUC1P15941 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUC1P15941 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MUC1P15941 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUC1P15941 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUC1P15941 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUC1P15941 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MUC1P15941 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MUC1P15941 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUC1P15941 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC1P15941 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC1P15941 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC1P15941 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC1P15941 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC1P15941 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC1P15941 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUC1P15941 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUC1P15941 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUC1P15941 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUC1P15941 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUC1P15941 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUC1P15941 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MUC1P15941 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MUC1P15941 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MUC1P15941 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MUC1P15941 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MUC1P15941 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MUC1P15941 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MUC1P15941 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MUC1P15941 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MUC1P15941 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MUC1P15941 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MUC1P15941 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms