Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH1P12830 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH1P12830 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH1P12830 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH1P12830 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH1P12830 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH1P12830 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH1P12830 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH1P12830 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH1P12830 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH1P12830 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH1P12830 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH1P12830 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH1P12830 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH1P12830 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH1P12830 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH1P12830 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH1P12830 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH1P12830 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH1P12830 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH1P12830 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH1P12830 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH1P12830 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH1P12830 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH1P12830 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH1P12830 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH1P12830 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH1P12830 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH1P12830 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH1P12830 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH1P12830 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH1P12830 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH1P12830 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH1P12830 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH1P12830 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH1P12830 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH1P12830 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH1P12830 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH1P12830 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH1P12830 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH1P12830 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH1P12830 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH1P12830 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH1P12830 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH1P12830 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH1P12830 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH1P12830 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH1P12830 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH1P12830 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH1P12830 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH1P12830 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH1P12830 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH1P12830 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH1P12830 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH1P12830 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH1P12830 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH1P12830 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH1P12830 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH1P12830 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH1P12830 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH1P12830 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH1P12830 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH1P12830 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH1P12830 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH1P12830 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH1P12830 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH1P12830 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH1P12830 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH1P12830 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH1P12830 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH1P12830 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH1P12830 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH1P12830 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH1P12830 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH1P12830 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH1P12830 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH1P12830 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH1P12830 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH1P12830 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH1P12830 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH1P12830 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH1P12830 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH1P12830 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH1P12830 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH1P12830 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH1P12830 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms