Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C8orf89P0DMQ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf89P0DMQ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C8orf89P0DMQ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C8orf89P0DMQ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C8orf89P0DMQ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C8orf89P0DMQ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms