Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC175P0C221 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC175P0C221 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC175P0C221 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC175P0C221 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC175P0C221 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms