Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCB1P08183 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCB1P08183 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB1P08183 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms