Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEFLP07196 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEFLP07196 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NEFLP07196 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEFLP07196 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEFLP07196 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEFLP07196 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEFLP07196 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFLP07196 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFLP07196 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEFLP07196 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
NEFLP07196 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NEFLP07196 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NEFLP07196 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NEFLP07196 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEFLP07196 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEFLP07196 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFLP07196 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFLP07196 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFLP07196 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFLP07196 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFLP07196 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFLP07196 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEFLP07196 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEFLP07196 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEFLP07196 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEFLP07196 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NEFLP07196 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEFLP07196 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEFLP07196 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEFLP07196 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEFLP07196 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEFLP07196 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NEFLP07196 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEFLP07196 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEFLP07196 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEFLP07196 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEFLP07196 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEFLP07196 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEFLP07196 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NEFLP07196 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEFLP07196 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEFLP07196 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEFLP07196 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEFLP07196 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEFLP07196 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEFLP07196 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEFLP07196 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.89■■■□□ 2.85
NEFLP07196 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEFLP07196 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEFLP07196 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEFLP07196 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEFLP07196 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEFLP07196 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEFLP07196 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEFLP07196 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEFLP07196 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEFLP07196 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEFLP07196 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFLP07196 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFLP07196 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEFLP07196 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEFLP07196 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEFLP07196 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEFLP07196 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEFLP07196 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEFLP07196 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEFLP07196 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFLP07196 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFLP07196 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFLP07196 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFLP07196 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFLP07196 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFLP07196 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFLP07196 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEFLP07196 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NEFLP07196 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NEFLP07196 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEFLP07196 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NEFLP07196 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFLP07196 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFLP07196 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFLP07196 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFLP07196 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFLP07196 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEFLP07196 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEFLP07196 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEFLP07196 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEFLP07196 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFLP07196 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFLP07196 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFLP07196 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFLP07196 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFLP07196 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFLP07196 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEFLP07196 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEFLP07196 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFLP07196 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFLP07196 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEFLP07196 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms