Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TFAP2AP05549 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TFAP2AP05549 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TFAP2AP05549 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAP2AP05549 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms