Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SERPIND1P05546 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SERPIND1P05546 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERPIND1P05546 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERPIND1P05546 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPIND1P05546 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.4 ms