Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCGP05129 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCGP05129 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCGP05129 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCGP05129 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCGP05129 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCGP05129 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCGP05129 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCGP05129 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCGP05129 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCGP05129 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKCGP05129 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCGP05129 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms