Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTRK1P04629 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NTRK1P04629 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NTRK1P04629 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NTRK1P04629 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.9 ms