Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOA1P02647 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA1P02647 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA1P02647 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA1P02647 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOA1P02647 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOA1P02647 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA1P02647 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA1P02647 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA1P02647 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA1P02647 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOA1P02647 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA1P02647 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA1P02647 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA1P02647 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA1P02647 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOA1P02647 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA1P02647 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA1P02647 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA1P02647 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA1P02647 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOA1P02647 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA1P02647 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA1P02647 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA1P02647 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOA1P02647 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA1P02647 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA1P02647 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA1P02647 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA1P02647 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOA1P02647 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA1P02647 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA1P02647 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA1P02647 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA1P02647 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA1P02647 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA1P02647 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA1P02647 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOA1P02647 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA1P02647 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA1P02647 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA1P02647 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA1P02647 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOA1P02647 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA1P02647 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA1P02647 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA1P02647 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOA1P02647 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOA1P02647 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOA1P02647 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA1P02647 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA1P02647 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA1P02647 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOA1P02647 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOA1P02647 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOA1P02647 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA1P02647 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA1P02647 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA1P02647 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA1P02647 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOA1P02647 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA1P02647 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA1P02647 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA1P02647 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOA1P02647 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA1P02647 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA1P02647 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA1P02647 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOA1P02647 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA1P02647 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOA1P02647 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA1P02647 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA1P02647 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOA1P02647 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA1P02647 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA1P02647 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA1P02647 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOA1P02647 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA1P02647 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA1P02647 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA1P02647 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA1P02647 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA1P02647 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOA1P02647 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APOA1P02647 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA1P02647 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA1P02647 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA1P02647 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA1P02647 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms