Protein–RNA interactions for Protein: P01766

IGHV3-13, Immunoglobulin heavy variable 3-13, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-13P01766 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-13P01766 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV3-13P01766 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-13P01766 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-13P01766 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms