Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CST1P01037 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST1P01037 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CST1P01037 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST1P01037 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST1P01037 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CST1P01037 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CST1P01037 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST1P01037 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST1P01037 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST1P01037 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CST1P01037 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CST1P01037 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST1P01037 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST1P01037 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST1P01037 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST1P01037 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST1P01037 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST1P01037 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST1P01037 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST1P01037 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST1P01037 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST1P01037 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CST1P01037 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST1P01037 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST1P01037 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST1P01037 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST1P01037 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST1P01037 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST1P01037 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST1P01037 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST1P01037 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST1P01037 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST1P01037 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST1P01037 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST1P01037 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST1P01037 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST1P01037 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST1P01037 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST1P01037 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST1P01037 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST1P01037 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST1P01037 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST1P01037 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST1P01037 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CST1P01037 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CST1P01037 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CST1P01037 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CST1P01037 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CST1P01037 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CST1P01037 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CST1P01037 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CST1P01037 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CST1P01037 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CST1P01037 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CST1P01037 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST1P01037 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST1P01037 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST1P01037 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST1P01037 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST1P01037 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CST1P01037 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CST1P01037 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CST1P01037 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CST1P01037 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CST1P01037 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CST1P01037 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CST1P01037 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST1P01037 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST1P01037 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST1P01037 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST1P01037 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST1P01037 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST1P01037 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST1P01037 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CST1P01037 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CST1P01037 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CST1P01037 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CST1P01037 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CST1P01037 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CST1P01037 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CST1P01037 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CST1P01037 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST1P01037 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST1P01037 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST1P01037 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST1P01037 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CST1P01037 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CST1P01037 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CST1P01037 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CST1P01037 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CST1P01037 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms