Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINA3P01011 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA3P01011 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA3P01011 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA3P01011 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms