Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX6O95503 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBX6O95503 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX6O95503 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX6O95503 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX6O95503 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX6O95503 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX6O95503 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX6O95503 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX6O95503 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX6O95503 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX6O95503 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX6O95503 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX6O95503 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX6O95503 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX6O95503 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX6O95503 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX6O95503 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX6O95503 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX6O95503 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBX6O95503 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX6O95503 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX6O95503 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX6O95503 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX6O95503 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX6O95503 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX6O95503 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX6O95503 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX6O95503 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX6O95503 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX6O95503 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX6O95503 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CBX6O95503 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX6O95503 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX6O95503 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX6O95503 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX6O95503 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX6O95503 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX6O95503 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX6O95503 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX6O95503 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX6O95503 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX6O95503 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX6O95503 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX6O95503 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX6O95503 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX6O95503 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX6O95503 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX6O95503 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX6O95503 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX6O95503 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX6O95503 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX6O95503 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX6O95503 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX6O95503 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX6O95503 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX6O95503 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX6O95503 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX6O95503 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX6O95503 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX6O95503 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX6O95503 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX6O95503 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX6O95503 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX6O95503 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX6O95503 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX6O95503 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX6O95503 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX6O95503 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX6O95503 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX6O95503 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX6O95503 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX6O95503 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX6O95503 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX6O95503 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX6O95503 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX6O95503 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX6O95503 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX6O95503 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX6O95503 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX6O95503 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX6O95503 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX6O95503 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX6O95503 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX6O95503 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX6O95503 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX6O95503 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX6O95503 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX6O95503 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX6O95503 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX6O95503 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX6O95503 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX6O95503 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX6O95503 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX6O95503 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX6O95503 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX6O95503 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX6O95503 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX6O95503 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX6O95503 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms