Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CAPN15O75808 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CAPN15O75808 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAPN15O75808 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPN15O75808 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms