Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALMO75781 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PALMO75781 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PALMO75781 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALMO75781 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALMO75781 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALMO75781 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PALMO75781 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMO75781 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMO75781 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMO75781 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMO75781 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMO75781 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMO75781 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMO75781 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PALMO75781 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PALMO75781 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PALMO75781 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALMO75781 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALMO75781 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PALMO75781 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PALMO75781 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PALMO75781 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALMO75781 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALMO75781 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PALMO75781 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALMO75781 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALMO75781 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PALMO75781 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALMO75781 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALMO75781 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALMO75781 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALMO75781 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PALMO75781 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALMO75781 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALMO75781 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALMO75781 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALMO75781 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALMO75781 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALMO75781 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PALMO75781 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALMO75781 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALMO75781 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALMO75781 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALMO75781 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PALMO75781 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PALMO75781 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALMO75781 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALMO75781 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALMO75781 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALMO75781 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALMO75781 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PALMO75781 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALMO75781 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALMO75781 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALMO75781 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALMO75781 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALMO75781 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PALMO75781 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALMO75781 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALMO75781 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALMO75781 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALMO75781 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALMO75781 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALMO75781 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALMO75781 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALMO75781 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALMO75781 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PALMO75781 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALMO75781 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALMO75781 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALMO75781 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALMO75781 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALMO75781 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALMO75781 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALMO75781 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PALMO75781 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PALMO75781 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PALMO75781 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PALMO75781 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PALMO75781 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PALMO75781 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PALMO75781 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALMO75781 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALMO75781 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PALMO75781 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PALMO75781 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PALMO75781 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PALMO75781 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PALMO75781 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PALMO75781 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PALMO75781 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms