Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMUO75648 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMUO75648 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRMUO75648 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMUO75648 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMUO75648 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMUO75648 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMUO75648 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMUO75648 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMUO75648 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRMUO75648 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMUO75648 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRMUO75648 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMUO75648 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMUO75648 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMUO75648 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMUO75648 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMUO75648 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRMUO75648 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRMUO75648 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRMUO75648 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMUO75648 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMUO75648 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMUO75648 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMUO75648 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMUO75648 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMUO75648 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMUO75648 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMUO75648 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMUO75648 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMUO75648 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMUO75648 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMUO75648 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMUO75648 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMUO75648 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMUO75648 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMUO75648 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMUO75648 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMUO75648 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMUO75648 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMUO75648 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMUO75648 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMUO75648 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMUO75648 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMUO75648 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMUO75648 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMUO75648 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMUO75648 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMUO75648 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRMUO75648 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMUO75648 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMUO75648 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMUO75648 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMUO75648 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMUO75648 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRMUO75648 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMUO75648 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMUO75648 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMUO75648 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRMUO75648 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMUO75648 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMUO75648 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMUO75648 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMUO75648 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMUO75648 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMUO75648 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRMUO75648 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMUO75648 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMUO75648 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMUO75648 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRMUO75648 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMUO75648 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRMUO75648 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMUO75648 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMUO75648 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMUO75648 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMUO75648 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMUO75648 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRMUO75648 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms