Protein–RNA interactions for Protein: O60763

USO1, General vesicular transport factor p115, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USO1O60763 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USO1O60763 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USO1O60763 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USO1O60763 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USO1O60763 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USO1O60763 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USO1O60763 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USO1O60763 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USO1O60763 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USO1O60763 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USO1O60763 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USO1O60763 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USO1O60763 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USO1O60763 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USO1O60763 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USO1O60763 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USO1O60763 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USO1O60763 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USO1O60763 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USO1O60763 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USO1O60763 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USO1O60763 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USO1O60763 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USO1O60763 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USO1O60763 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USO1O60763 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USO1O60763 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USO1O60763 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USO1O60763 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USO1O60763 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USO1O60763 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USO1O60763 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USO1O60763 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USO1O60763 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USO1O60763 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USO1O60763 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USO1O60763 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USO1O60763 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USO1O60763 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USO1O60763 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USO1O60763 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USO1O60763 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USO1O60763 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USO1O60763 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USO1O60763 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USO1O60763 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USO1O60763 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USO1O60763 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USO1O60763 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USO1O60763 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USO1O60763 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USO1O60763 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USO1O60763 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USO1O60763 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USO1O60763 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USO1O60763 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USO1O60763 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USO1O60763 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USO1O60763 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USO1O60763 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USO1O60763 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USO1O60763 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USO1O60763 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USO1O60763 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USO1O60763 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USO1O60763 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USO1O60763 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USO1O60763 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USO1O60763 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USO1O60763 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USO1O60763 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USO1O60763 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USO1O60763 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USO1O60763 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USO1O60763 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USO1O60763 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USO1O60763 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USO1O60763 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USO1O60763 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USO1O60763 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USO1O60763 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USO1O60763 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
USO1O60763 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
USO1O60763 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USO1O60763 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USO1O60763 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USO1O60763 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USO1O60763 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms