Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMDSO60547 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMDSO60547 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GMDSO60547 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMDSO60547 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMDSO60547 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GMDSO60547 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GMDSO60547 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMDSO60547 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMDSO60547 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMDSO60547 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMDSO60547 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GMDSO60547 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GMDSO60547 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMDSO60547 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GMDSO60547 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GMDSO60547 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GMDSO60547 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GMDSO60547 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMDSO60547 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMDSO60547 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMDSO60547 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GMDSO60547 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMDSO60547 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMDSO60547 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMDSO60547 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMDSO60547 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GMDSO60547 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMDSO60547 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GMDSO60547 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMDSO60547 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMDSO60547 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMDSO60547 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMDSO60547 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMDSO60547 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GMDSO60547 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GMDSO60547 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMDSO60547 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMDSO60547 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMDSO60547 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMDSO60547 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMDSO60547 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GMDSO60547 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMDSO60547 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMDSO60547 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMDSO60547 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMDSO60547 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMDSO60547 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GMDSO60547 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMDSO60547 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMDSO60547 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMDSO60547 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GMDSO60547 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GMDSO60547 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMDSO60547 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMDSO60547 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMDSO60547 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMDSO60547 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GMDSO60547 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMDSO60547 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GMDSO60547 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMDSO60547 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GMDSO60547 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GMDSO60547 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMDSO60547 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMDSO60547 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMDSO60547 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMDSO60547 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMDSO60547 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMDSO60547 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GMDSO60547 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GMDSO60547 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMDSO60547 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMDSO60547 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMDSO60547 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GMDSO60547 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GMDSO60547 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMDSO60547 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMDSO60547 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMDSO60547 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMDSO60547 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMDSO60547 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMDSO60547 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GMDSO60547 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMDSO60547 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMDSO60547 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMDSO60547 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GMDSO60547 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GMDSO60547 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms