Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRAK2O60296 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRAK2O60296 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRAK2O60296 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRAK2O60296 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms