Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC28A2O43868 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A2O43868 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC28A2O43868 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC28A2O43868 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms