Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EEF1E1O43324 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EEF1E1O43324 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EEF1E1O43324 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1O43324 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1O43324 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1O43324 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1O43324 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EEF1E1O43324 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms