Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTDSPLO15194 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTDSPLO15194 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSPLO15194 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPLO15194 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPLO15194 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPLO15194 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPLO15194 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms