Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
O00370 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
O00370 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
O00370 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
O00370 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
O00370 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
O00370 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
O00370 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
O00370 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
O00370 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
O00370 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
O00370 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
O00370 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
O00370 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
O00370 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
O00370 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
O00370 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
O00370 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
O00370 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
O00370 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
O00370 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
O00370 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
O00370 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
O00370 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
O00370 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
O00370 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
O00370 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
O00370 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
O00370 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
O00370 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
O00370 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
O00370 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
O00370 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
O00370 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
O00370 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
O00370 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
O00370 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
O00370 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
O00370 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
O00370 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
O00370 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
O00370 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
O00370 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
O00370 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
O00370 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
O00370 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
O00370 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
O00370 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
O00370 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
O00370 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
O00370 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
O00370 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
O00370 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
O00370 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
O00370 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
O00370 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
O00370 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
O00370 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
O00370 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
O00370 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
O00370 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
O00370 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
O00370 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
O00370 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
O00370 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
O00370 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
O00370 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
O00370 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
O00370 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
O00370 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
O00370 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
O00370 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
O00370 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
O00370 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
O00370 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
O00370 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
O00370 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
O00370 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
O00370 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
O00370 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
O00370 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
O00370 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
O00370 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
O00370 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
O00370 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
O00370 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
O00370 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
O00370 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
O00370 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
O00370 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
O00370 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
O00370 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
O00370 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
O00370 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
O00370 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
O00370 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
O00370 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
O00370 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
O00370 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
O00370 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms