Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1C5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1C5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C1C5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1C5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1C5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1C5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1C5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C1C5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1C5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1C5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1C5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1C5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C1C5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1C5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1C5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1C5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1C5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C1C5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1C5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1C5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1C5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1C5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1C5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1C5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1C5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1C5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1C5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1C5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1C5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1C5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1C5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1C5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1C5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1C5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1C5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1C5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1C5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1C5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C1C5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1C5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1C5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1C5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1C5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C1C5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1C5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C1C5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C1C5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C1C5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C1C5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1C5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C1C5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C1C5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C1C5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C1C5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C1C5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C1C5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C1C5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C1C5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C1C5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C1C5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C1C5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C1C5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C1C5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C1C5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C1C5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C1C5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C1C5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C1C5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C1C5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C1C5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C1C5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C1C5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C1C5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C1C5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C1C5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1C5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1C5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1C5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1C5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1C5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C1C5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C1C5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C1C5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C1C5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C1C5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C1C5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1C5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1C5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C1C5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms