Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP99D6REC4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP99D6REC4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP99D6REC4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP99D6REC4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP99D6REC4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP99D6REC4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP99D6REC4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms