Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM114B3SHH9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM114B3SHH9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM114B3SHH9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM114B3SHH9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM114B3SHH9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms