Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00587B1AMM8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00587B1AMM8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00587B1AMM8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00587B1AMM8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00587B1AMM8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms