Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO5BA8MYB1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO5BA8MYB1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMCO5BA8MYB1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMCO5BA8MYB1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO5BA8MYB1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO5BA8MYB1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMCO5BA8MYB1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms