Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM247A6NEH6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM247A6NEH6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM247A6NEH6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms