Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT87PA6NCN2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT87PA6NCN2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT87PA6NCN2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT87PA6NCN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms