Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSDA5PKW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PSDA5PKW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PSDA5PKW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PSDA5PKW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PSDA5PKW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms