Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J293

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J293 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J293 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A0B4J293 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A0B4J293 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0B4J293 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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